萬級無菌室容積小而嚴(yán)密，使用一段時(shí)間后，室內(nèi)溫度很高，故應(yīng)設(shè)置通氣窗。通氣窗應(yīng)設(shè)在內(nèi)室進(jìn)門處的頂棚上(即離工作臺zui遠(yuǎn)的位置)，為雙層結(jié)構(gòu)，外層為百葉窗，內(nèi)層可用抽板式窗扇。通氣窗可在內(nèi)室使用后、自凈前開啟，以流通空氣。有條件可安裝恒溫恒濕機(jī)。無菌室內(nèi)設(shè)備和用具，無菌室內(nèi)的工作臺，不論是什么材質(zhì)、用途的，都要求表面光滑和臺面水平。在內(nèi)室和外室各安裝一個(gè)紫外燈(多為30W)。內(nèi)室的紫外線燈應(yīng)安裝在經(jīng)常工作的座位正上方，離地面2m，外室的紫外線燈可安裝在外室。
萬級無菌室有足夠的存儲空間擺放物品以方便使用。在實(shí)驗(yàn)室工作區(qū)域處還有供使用的存儲空間。在實(shí)驗(yàn)室的工作區(qū)域處應(yīng)有存放個(gè)人衣物的條件。在實(shí)驗(yàn)室所有的建筑內(nèi)配備高壓蒸汽自凈器，并按期檢查和驗(yàn)證，以保證符合要求。在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)配備生物安全柜。設(shè)洗眼設(shè)施，必要時(shí)應(yīng)有應(yīng)急噴淋裝置。考慮機(jī)械通風(fēng)，如使用窗戶自然通風(fēng)，有防蟲紗窗。有可靠的電力供應(yīng)和應(yīng)急照明。必要時(shí)，重要設(shè)備如培養(yǎng)箱、生物安全柜、冰箱等應(yīng)設(shè)備用電源。實(shí)驗(yàn)室出口有在黑暗是可明確辨認(rèn)的標(biāo)識。
萬級無菌室應(yīng)有內(nèi)、外兩間，內(nèi)間是無菌室，外間是緩沖室。房間容積不宜過大，以便于空氣自凈。內(nèi)間面積2 ×2.5＝5m2，外間面積1 × 2＝2m2，高以2.5m以下為宜，都應(yīng)有天花板。內(nèi)間應(yīng)當(dāng)設(shè)拉門，以減少空氣的波動，門應(yīng)設(shè)在離工作臺zui遠(yuǎn)的位置上，外間的門也用拉門，要設(shè)在距內(nèi)間zui遠(yuǎn)的位置上。在分隔內(nèi)間與外間的墻壁或 "隔扇 "上，應(yīng)開一個(gè)小窗，作接種過程中必要的內(nèi)外傳遞物品的通道，以減少人員進(jìn)出內(nèi)間的次數(shù)，降低污染程度。小窗寬60cm、高40cm、厚30cm，內(nèi)外都掛對拉的窗扇。
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